Molekularbiologische Untersuchungen - PCR
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Sinn und Zweck der PCR
PCR ist die Abkürzung für Polymerase Chain Reaction (dt.: Polymerase Kettenreaktion). Grundsätzlich ist diese Methode vereinfacht gesagt eine enzymatische Vermehrung von DNA (Erbmaterial).
Aus wenigen, theoretisch einem DNA-Molekül, können in wenigen Stunden Milliarden identische DNA-Fragmente hergestellt werden.
Das Ergebnis einer Untersuchung ist ohne Spezialtechniken nur qualitativ, d.h. ist ein PCR-Produkt detektierbar oder nicht.
Für die Diagnostik kann diese Methode angewendet werden, weil man über Primer (das sind kurze DNA-Fragmente die den Start- und Endpunkt des zu vermehrenden DNA-Stücks markieren) genau steuern kann was vermehrt wird.
Solche Primer können so konstruiert werden, dass sie nur ein PCR Produkt ergeben wenn die DNA von einem bestimmten Krankheitserreger vorhanden ist.
Damit hat die Methode im optimalen Fall eine Spezifität von 100 %. Primer können auch so konstruiert werden, dass Sie für ganze phylogenetische Gruppen (z.B. Säugetiere, Bakterien, Pilze, etc.) spezifisch sind.
In diesem Fall wird dann mit einer DNA-Sequenzierung identifiziert von welcher Art die Proben DNA stammt
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Untersuchungsmethoden
Die PCR wurde das erste Mal 1985 von Kary Mullis durchgeführt. Seit damals haben sich viele unterschiedliche Methoden entwickelt.
Konventionelle PCR:
Dies ist vereinfacht gesagt die Urform der PCR, so wie sie Mullis auch durchgeführt hat. Dabei wird ein PCR Produkt nach der enzymatischen Vermehrung auf ein Agarosegel aufgetragen. Ist am Agarosegel ein spezifisches DNA Fragment sichtbar, dann ist das Ergebnis positiv.
Real Time PCR:
Ist eine Weiterentwicklung der konventionellen PCR. Dabei wird während der PCR schon gemessen ob es zu einer Vermehrung von DNA im Reaktionsgefäß kommt. Die Detektion läuft also in Echtzeit (engl. realtime) ab. Ein Vorteil ist somit, dass die Untersuchung kürzer dauert, weil ich nach der PCR das Produkt nicht noch auf dem Agarosegel detektieren muss. Ein weiterer Vorteil ist, dass ich mit dieser Methode auch quantitative Untersuchungen machen kann. Das heißt ich kann am Ende der PCR Rückrechnen wie viel DNA am Anfang in der Probe war und kann somit eine Berechnung der Anzahl an z.B. Krankheitserregern in einer Probe machen. Dies ist bei einigen Krankheitserregern von Bedeutung (z.B. PCV2), weil eine geringe Anzahl der Erreger keine klinische Bedeutung hat, und damit eine quantitative Analyse für die Befundinterpretation von Bedeutung ist.
RT PCR:
Viele Viren beinhalten keine DNA als Erbsubstanz, sondern RNA (z.B. PRRSV, HIV, BTV, BVD). Damit man diese Krankheitserreger mit einer PCR detektieren kann muss man die RNA zuerst in DNA „umschreiben“. Da dieser Schritt eine Umkehrung der molekularen Vorgänge in den Zellen ist, wo normalerweise die DNA in RNA umgeschrieben wird, bezeichnet man diese Methode als „Reverse Transkription“.
Die so hergestellte DNA kann dann wieder in einer normalen PCR vervielfältigt und detektiert werden. Das kann sowohl in einer konventionellen als auch einer real time PCR passieren.
Weitere Methoden:
Die Anzahl an verschiedenen PCR-Methoden nimmt von Jahr zu Jahr zu. Insgesamt ist die PCR in der Zwischenzeit die wichtigste Methode in der naturwissenschaftlichen Forschung. In 90 % aller Publikationen im „Life-Science“ Bereich findet sich eine PCR Methode. In Zukunft wird auch in der klinischen Diagnostik die PCR mehr und mehr die klassischen Methoden (Serologie, Kultur, etc.) ersetzen.
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Hinweise zum Probenversand
Die Proben sollten so rasch wie möglich, am besten gekühlt, an die Untersuchungsstelle gebracht werden; ist dies nicht möglich, müssen die Proben im Kühlschrank bei +4°C aufbewahrt werden, da sonst wegen starker Hämolyse oder bakterieller Zersetzung eine ordnungsgemäße Untersuchung unter Umständen nicht mehr möglich ist.
Es ist darauf zu achten, dass die Probenröhrchen gut verschlossen werden oder das Probenmaterial gut verpackt wird, damit ein Probenverlust ausgeschlossen ist.
Gebrauchte Injektionsnadeln sind aus Sicherheitsgründen unbedingt zu entfernen! Blutprobenröhrchen sind fortlaufend zu nummerieren und auf dem Untersuchungsantrag den Tieren entsprechend zuzuordnen.
Bitte verwenden sie die entsprechenden Einsendeformulare der Landesanstalt (Hier kommen Sie zu den
Einsendeformularen) und füllen diese vollständig und korrekt aus.
Bei allen Untersuchungsanträgen ist der Untersuchungsgrund mitzuteilen, damit unter anderem der Kostenträger festgestellt werden kann. Es ist zwingend erforderlich, dass die Untersuchungsaufträge mit dem Stempel und der Unterschrift des Einsendetierarztes versehen werden.
Wir weisen ausdrücklich darauf hin, dass wir Proben mit nicht unterfertigten Einsendeformularen aus Qualitätssicherungsgründen, die uns das Akkreditierungsgestz vorgibt, nicht bearbeiten dürfen.
Für die PCR-Diagnostik sind Blutproben mit Zusatz von EDTA geeignet. Bitte verwenden Sie keine Heparin oder Citrat-Röhrchen da diese die PCR-Reaktion inhibieren und wir somit für die Ergebnisse nicht garantieren können.
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An der Landesanstalt durchgeführte
Untersuchungen, Untersuchungstarife tabellarisch
PCR Untersuchungen Kleintier
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Tierart |
Parameter |
Probenmaterial |
Preis in € |
| Katze/Hund |
Borellien |
EDTA-Blut, Serum, Punktate |
25,- |
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Mycoplasmen allgem. |
div. Gewebe, Tupfer, Sekret, Exkret |
25,- |
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Hämoplasmen |
EDTA-Blut |
25,- |
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Leishmanien |
EDTA-Blut, Serum, Gewebe |
35,- |
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Anaplasmen |
EDTA-Blut |
20,- |
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Leptospiren |
EDTA-Blut, Serum, Harn, Gewebe |
35,- |
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Chlamydien |
Tupfer, Sekret |
20,- |
| Katze |
Felines Herpesvirus |
Tupfer |
25,- |
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Felines Calicivirus |
Tupfer |
25,- |
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FHV/FCV Kombi |
Tupfer |
45,- |
| Hund |
Staupevirus |
EDTA-Blut, Synovialflüssigkeit |
35,- |
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Parvovirus |
Kottupfer |
18,- |
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Ehrlichia canis |
EDTA-Blut |
35,- |
PCR Untersuchungen Großtier
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Tierart |
Parameter |
Probenmaterial |
Preis in € |
| Wiederkäuer |
BVDV |
EDTA-Blut, Plasma, Serum
Leukozytenfraktion, Samen
Organe
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BTV |
EDTA-Blut (Vollblut) |
15,- |
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Mykoplasmen ** |
Milch (inkl. BU) |
25,- |
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ParaTBC ** |
Darmbioptate, Milch |
38,- |
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Coxiella burnetii |
Abortmaterial |
25,- |
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Hämoplasmen |
EDTA-Blut |
25,- |
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Leptospiren |
EDTA-Blut, Serum, Harn, Gewebe |
35,- |
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Chlamydien |
Tupfer, Sekret |
20,- |
| Schwein |
PCV2 (quantitativ) |
EDTA-Blut, Samen, Organe |
20,- |
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PRRSV |
EDTA-Blut, Plasma, Serumm
Speichelproben, Organe
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20,- |
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PCV2/PRRSV Kombi |
siehe Einzeluntersuchung |
35,- |
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Hämoplasmen |
EDTA-Blut |
25,- |
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Leptospiren |
EDTA-Blut, Serum, Harn, Gewebe |
35,- |
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Chlamydien |
Tupfer, Sekret |
20,- |
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Mycoplasmen allgem. |
div. Gewebe, Tupfer, Sekret, Exkret |
25,- |
| Pferd |
EHV 1 + 4 |
Tupfer |
30,- |
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Taylorella equigenitalis |
Genitaltupfer |
25,- |
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Hämoplasmen |
EDTA-Blut |
25,- |
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Leptospiren |
EDTA-Blut, Serum, Harn, Gewebe |
35,- |
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Chlamydien |
Tupfer, Sekret |
20,- |
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Mycoplasmen allgem. |
div. Gewebe, Tupfer, Sekret, Exkret |
25,- |
* die öffentliche Hand trägt die Laborkosten
** diese Untersuchungen können nur partienweise, in periodischen Abständen (im Rahmen von Projekten) bearbeitet werden.
Für Einzeluntersuchungen würde sich der Preis um ein Vielfaches erhöhen.
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PCR Untersuchungen Geflügel
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Tierart |
Parameter |
Probenmaterial |
Preis in € |
| Alle Arten |
Mykoplasmen** |
Organe, Trachealtupfer, Exkrete
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25,- |
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** diese Untersuchungen können nur partienweise, in periodischen Abständen (im Rahmen von Projekten) bearbeitet werden.
Für Einzeluntersuchungen würde sich der Preis um ein Vielfaches erhöhen.
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PCR Untersuchungen Fische, Dekapoden (Flusskrebse, Garnelen, etc.)
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Tierart |
Parameter |
Probenmaterial |
Preis in € |
| Fische |
VHS (semi-quantitiv) |
Organe |
20,- |
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IHN (semi-quantitiv) |
Organe |
20,- |
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IPN |
Organe |
20,- |
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VHS/IHN |
Organe |
35,- |
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VHS/IHN/IPN |
Organe |
45,- |
| Crustaceae |
WSSV (semi-quantitiv) |
Tierkörper |
35,- |
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Krebspest (inkl. Kultur) |
Tierkörper |
30,- |
PCR Untersuchungen Vögel
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Tierart |
Parameter |
Probenmaterial |
Preis in € |
| alle Arten |
Chlamydien |
Tupfer, Gewebe |
20,- |
weitere PCR Untersuchungen
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Parameter |
Probenmaterial |
Preis in € |
| Bakterienidentifizierung (16S rDNA) |
Bakterienreinkultur |
25,- |
Wir sind bemüht unser Programm ständig zu erweitern. Spezielle Untersuchungen können nach Rücksprache auch im Einzelfall durchgeführt werden (z.B.:genetische Analysen von Proben, Tierartendifferenzierung).
Für molekularbiologische Analysen von Lebensmitteln (GVO, EHEC, Salmonella) wenden Sie sich bitte an die LUA-Kärnten www.lua.ktn.gv.at.
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Besondere Hinweise (Probenbearbeitung)
Die Untersuchung auf BTV erfolgt jeweils Mittwoch und Donnerstag; die Proben müssen bis 8.00 Uhr im Labor sein, das Ergebnis wird am gleichen oder darauffolgenden Arbeitstag übermittelt.
Für Termin- und sonstige Auskünfte wenden Sie sich bitte an Hr. Dr. Gunther Vogl oder Fr. Dr. Melanie Lippert-Petscharnig.
Folgende Untersuchungsanträge stehen zur Verfügung:
Serologie_PCR Untersuchungsantrag (unter Sonstiges BTV-AG/Mykoplasmen/WSSV/Krebspest-PCR eintragen)
Untersuchungsantrag Blutuntersuchungen Schwein
Untersuchungsantrag Fischuntersuchungen
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